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viernes, 5 de julio de 2019

Modificación al azar del genoma en bacterias

Las bacterias son uno de los organismos más utilizados a lo largo de la historia de la biología, permitiéndonos hacer importantes descubrimientos sobre procesos moleculares, metabólicos, genéticos, etc.

Genoma de bacteria y biologia

Estos descubrimientos y estudios se han podido llevar a cabo gracias a las técnicas de modificación genética que nos han dado la opción de diseñar bacterias con las características necesarias.

martes, 13 de noviembre de 2012

El genoma, los genes y las familias de genes del hombre

Antes de abordar en detalle la descripción de las técnicas del ADN recombinante, es oportuno destacar algunas informaciones –genoma, genes y familias de genes– que permitirán comprender mejor la utilidad de esta metodología para el descubrimiento de enfermedades genéticas humanas.

Genoma, genes, y biologia

- Genoma humano y genes


En los artículos precedentes ya hemos descrito de qué manera se transmite la información genética del ADN al ARN, y de este último a las proteínas. Sabemos además que el genoma humano haploide está constituido por 3 x 10 elevado a 9 pares de nucleótidos: de éstos, un 30% aproximadamente es ADN repetitivo, es decir, constituido por secuencias de bases que se repiten muchas veces; mientras que el 70% (unos 2 x 10 elevado a 9 pares) está constituido por ADN de secuencia única, presente una sola vez en el genoma. Solamente el 10% de este último ADN, equivalente a 2 x 10 elevado a 8 pares de bases, se transcribe en ARN mensajero que abandona el núcleo para ser traducido en el citoplasma. Si se calcula que la longitud media de una molécula de ARN mensajero, capaz de codificar una proteína, es de 1.500 nucleótidos (2 x 10 elevado a 8 / 1.500 = 130.000), resulta que el genoma humano debería contener unas 130.000 unidades independientes, es decir, 130.000 genes estructurales. Pero muchos genes estructurales se repiten muchas veces en el genoma humano; en consecuencia, se cree que la cantidad de proteínas humanas codificadas por el genoma oscila entre las 30.000 y las 100.000. Éste es, por tanto, el número estimado de genes repartidos entre los 24 cromosomas humanos (22 autosomas y 2 heterocromosomas, X e Y). Las dimensiones de los genes pueden variar entre unos pocos centenares de bases de ADN hasta más de un millón.

Hemos visto en los artículos anteriores que los genes eucariotas se organizan de manera que las secuencias que codifican aminoácidos, los exones, están intercaladas con secuencias que no se traducen, llamadas intrones, de las que se desconoce todavía su función. Tomemos como ejemplo el gen de la hemoglobina del hombre adulto. Como ya se ha dicho, la hemoglobina es un tetrámero, es decir, una proteína compuesta por cuatro subunidades iguales dos a dos: dos cadenas alfa y dos cadenas beta: los genes de las cadenas alfa y los de la beta están situados en cromosomas distintos: las primeras cadenas se cartografían en el cromosoma 16, y las segundas en el cromosoma 11.

El gen correspondiente a la cadena alfa está formado por 800 pares de bases, mientras que el de la cadena beta tiene una longitud casi doble de la anterior; contra lo que cabría esperar, sin embargo, las proteínas producidas por los genes de ambos tipos poseen similar longitud: las cadenas alfa están formadas por 141 aminoácidos, y las beta, por 146. Ello es así por la distinta dimensión, en los dos genes, de los intrones, que se transcriben en el ARN mensajero pero son cortados y retirados (spliced) antes de que aquél se traduzca en proteínas.

Genes y biologia


- Las familias de genes


A veces, genes con funciones similares se encuentran situados en cromosomas próximos unos a otros: se dice que los genes de este tipo están organizados en familias. Este es el caso de la familia de genes de la hemoglobina. Al comienzo de este artículo se ha dicho que aproximadamente el 30% del ADN genómico lo integran secuencias repetidas cuya función se está estudiando todavía. Entre éstas, las más comunes son las llamadas secuencias Alu, formadas por unos 300 pares de bases que se repiten muchas veces en el genoma humano.

jueves, 8 de noviembre de 2012

El genoma

El término genoma designa el material genético de un organismo: o sea, el ADN de una célula. En los organismos pluricelulares el ADN es el mismo en todas las células del organismo, y por genoma de un individuo se entiende el genoma contenido en cualquiera de las células que lo integran.

Genoma y biologia

- La dimensión del genoma


Su dimensión varía proporcionalmente a la complejidad del organismo: cuanto más complejo es un organismo, mayor es también la cantidad de ADN, y en consecuencia de genes, contenida en sus células.

- Genoma en las células eucariotas y en las células procariotas


El genoma de las células eucariotas es diploide porque consiste en un ejemplar doble de cromosomas.

El genoma de la Escherichia coli está compuesto por 3,2 x 10 elevado a 6 (3,2 millones) de pares de nucleótidos, mientras que el genoma humano es mil veces mayor y está compuesto por tres mil millones de bases. Se sabe que la bacteria Escherichia coli puede producir algunos miles de proteínas distintas y que, por lo tanto, su genoma posee igual número de genes; siguiendo este razonamiento, las células de los mamíferos han de poseer varios millones de genes distintos, cifra inverosímil si se piensa que buena parte del metabolismo y, en consecuencia, de las enzimas es muy similar tanto en las bacterias como en los mamíferos. ¿Cómo han de interpretarse entonces estos datos? Mientras que en los virus y en las células procariotas la cantidad de ADN parece ser proporcional al número de genes y a la complejidad de la célula, esta relación no resulta válida para los organismos eucariotas. De hecho, anfibios como la rana y la salamandra poseen un genoma mucho más extenso que el humano, lo cual querría decir que estos animales han evolucionado más que nosotros. Como resulta lógico suponer que los individuos de especies semejantes poseen un grado de complejidad equivalente y, en consecuencia, un número similar de genes, estos datos sugieren que buena parte del ADN contenido en las células eucariotas no contiene información genética y, por lo tanto, no determina la síntesis de proteínas.

Al analizar la velocidad con que las dos hélices del ADN se unen (se renaturalizan) tras haber sido separadas (desnaturalizadas), se ha demostrado que gran parte del ADN de las células eucariotas no determina la síntesis de ninguna proteína y se compone de secuencias repetidas un gran número de veces en el genoma. De acuerdo con esta resultado, el ADN eucariótico se subdivide en ADN de secuencias únicas, del cual está presente en el genoma una copia única o unas pocas y que corresponde a los genes estructurales que determinan la síntesis de proteínas; y en ADN de secuencias repetitivas, constituido por unos pocos pares de bases que se repiten de unos cientos de miles a millones de veces en el genoma sin presentar secuencias codificadas.